¿Porque se desordena la posición de los objetos al reabrir un archivo?

Hola comunidad de blender!, hace días estoy teniendo problemas con la posición de los objetos en una escena de un proyecto de visualización arquitectónica que estoy trabajando. El edificio esta conformado por elementos modulares los cuales se acomodan de tal manera que sean muros, columnas, cubiertas, ventanas etc. el problema es a la hora de guardar el archivo y cerrar blender, al reabrir el archivo los objetos que estaban previamente acomodados en su sitio aparecen desplazados en otro sitio o encimados en un mismo sitio, uno sobre otro, rotados en posiciones totalmente distintas que cuando guarde y cerré el archivo.

Imagen del modelo guardado y antes de cerrar el archivo:

Imagen después de reabrir el archivo:

Ya apliqué la locación, la rotación y la escala de todos lo objetos y sigue ocurriendo el mismo desorden de posición.

También me sucede cuando quiero exportar algún objeto a fbx u otro formato para texturizarlo en Subtance painter,

1.-Selecciono el objeto que deseo exportar 2.-Aparece la ventana del directorio y opciones de exportado 3.-Tildo la casilla "Selected Objects" 4.-Aceptar y procesa por unos segundos... 5.-Cuando regresa al viewport 3d el objeto exportado esta movido de posición a veces rotado.

Tengo poco usando blender, quizás y estoy pasando por alto algo muy básico, he buscado este problema en Internet y no he encontrado nada similar y no tengo idea a que se deba este desorden de posiciones de objetos.

Espero haberme expresado claramente, si hay alguien que sepa a que se debe el problema, se lo agradezco de antemano, Saludos.